Для минимизации фактора патоморфологической гетерогенности при исследовании болезни Паркинсона (БП) Генетический консорциум по аутопсийно-подтвержденной БП провел полногеномный скрининг с поиском ассоциаций (GWAS) у пациентов с патоморфологически верифицированным диагнозом. Для этого были генотипированы 484 пациента с БП и 1145 лиц контрольной группы, все случаи были патоморфологически исследованы. В рамках GWAS были исследованы 3 922 209 полиморфизмов. Выявлено, что небольшой регион на 1-й хромосоме ассоциирован с развитием БП (rs10788972, p = 6,2 × 10–8). Ассоциированный пик расположен вблизи пиков из двух предшествующих исследований, определивших локус PARK10. Также было продемонстрировано неравновесное сцепление полиморфизмов rs10788972 и rs914722 – последний является однонуклеотидным полиморфизмом, определяющим ассоциированный с возрастом начала болезни гаплотип PARK10. Область, содержащая локус PARK10, была значительно уменьшена – с 10,6 Мб до 100 Кб. При этом были определены 4 гена-кандидата, содержащиеся в этой области: TCEANC2, TMEM59, miR-4781, LDLRAD1. Таким образом, в исследовании была подтверждена ассоциация гаплотипа PARK10 с риском развития идиопатической БП. Более того, в результате работы удалось значительно уменьшить размер области, содержащей PARK10. Ни один из кандидатных генов в области PARK10 ранее не был описан как значимый для патогенеза БП, что может служить отправной точкой для дальнейших исследований. Кроме того, было показано, что уменьшение патоморфологической гетерогенности может значительно усиливать генетические ассоциации при БП.
30 сентября 2022